抱殘守缺的黃埔傳統，至今仍束縛著臺灣軍隊的現代化改革。

世界各先進民主國家，大都為專業文人領軍，而非採用退伍將領主導國防，臺灣是民主國家中的特例，一向為黃埔軍人把持軍隊，維護所謂「光榮傳統」不遺餘力，所以訓練、戰術、準則和戰略，都包圍著由職業軍人掌控的情境，無法如歐美日等國家那樣，進入「第四波戰爭型態」。

那些參加共產黨軍隊的黃埔畢業生，公然與校長作戰，被國民黨稱為「赤黃埔系」。可見，意識型態的吸引力大於領袖的個人魅力。這是蔣介石一輩子都未能明白的道理。

在抗日戰場上，大都是非黃埔系將領贏得重大勝利，令國人、敵手及盟軍刮目相看的中國將領大都非黃埔出身──李宗仁、白崇禧、孫立人、廖耀湘[33]、張發奎、薛岳、張自忠、李家鈺……然而，正因為他們不是黃埔系，從來得不到蔣的信任和重用。

正因為蔣的私心和賞罰不明，使國軍的戰力難以提升，對日作戰八年間屢戰屢敗，三年多的國共內戰更一潰千里。